В семействе различают четыре рода миксиновых: собственно миксины (Myxine), тонкотелые миксины (Nemamyxine), пиявкоротые миксины (Eptatretus, Bdellostoma) и парамиксины (Paramyxine). У двух первых родов имеется по одной паре наружных жаберных отверстий. Они ведут в два жаберных канала, к которым подходят трубки от 5—7 жаберных мешков. У пиявкоротых миксин от 5 до 15 довольно крупных наружных жаберных отверстий, имеющих круглую форму и широко раздвинутых, так что расстояние между крайними, первым и последним, отверстиями значительно больше высоты тела.